基因表达聚类结果的信息熵评价方法

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基因表达聚类结果的信息熵评价方法

易东;杨梦苏;李辉智;黄明辉;王文昌

【期刊名称】《第三军医大学学报》 【年(卷),期】2004(26)4

【摘 要】目的 探讨基因表达数据聚类结果信息熵评价方法 ,为合理地选择聚类方法提供一种定量评价依据。方法 采用entropy信息熵方法 ,考察常用的六种聚类方法所得到的分类结果与部分已知功能基因分类之间的符合程度 ,并将该指标作为一种评价依据。结果 将该方法应用于Lyer的血清刺激表达数据集聚类结果的评价 ,给出了六种聚类方法的entropy图。结论 本研究首次提出用熵理论评价聚类结果 ,并观察到同一数据集由于功能聚类信息的不同而引起的评价结果的差异。 【总页数】3页(P317-319)

【关键词】基因表达;聚类分析;评价;entropy信息熵 【作 者】易东;杨梦苏;李辉智;黄明辉;王文昌

【作者单位】第三军医大学预防医学系卫生统计学教研室;香港城市大学基因组科技应用研究中心;西南政法大学刑侦学院电子技术教研室,重庆400031 【正文语种】中 文

【中图分类】R195.1;R394-33 【相关文献】

1.一种基于信息熵的聚类结果评价方法 [J], 张敞;王园园;赵裕啸;伍章俊 2.基因表达数据聚类分析结果的评价方法研究 [J], 易东;杨梦苏;李辉智;黄明辉;王


文昌

3.河南省高等教育资源配置评价指标体系研究——基于改进的信息熵的蚁群聚类方法 [J], 陈岩

4.一种在基因表达数据集中全局检测共调控基因的双聚类方法 [J], 安平;邓伟 5.用基因芯片的方法对人酪蛋白激酶CK1γ1基因进行表达谱和聚类分析 [J], 唐榕;应康;陈宣茂;孙朝辉;石军;吴超群;黄燕;刘建平;李瑶;谢毅;毛裕民

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